Franciszek Witaszek urodził się 8 września 1908 r. w Śmiglu w kupieckiej rodzinie. Medycynę ukończył w 1931 r. na Uniwersytecie Poznańskim. Po uzyskaniu dyplomu lekarskiego podjął pracę w Zakładzie Mikrobiologii na macierzystej uczelni. Szybko dał się poznać jako utalentowany naukowiec. Prowadził m.in. badania nad szybkością opadania krwinek w przebiegu gruźlicy u dzieci i dorosłych. W 1936 r. został współzałożycielem zakładu Serovac Poznański produkującego surowice i szczepionki, a w latach 1937–1939 stał na czele firmy Catgut Polska zajmującej się produkcją nici operacyjnych do szycia ran.