Muzeum mieści się w oryginalnie zachowanym domu rodzinnym Marii Pileckiej. To właśnie w Ostrowi Mazowieckiej wychowała się Maria Ostrowska, z którą Witold Pilecki wziął ślub. Po wybuchu wojny miasto znalazło się na granicy Generalnego Gubernatorstwa i Związku Sowieckiego. Maria Pilecka schroniła się tam wraz z dziećmi, mieszkała tam w czasie służby Witolda w armii Andersa i jego sfabrykowanego procesu przed komunistycznym sądem.
- Zadaniem naszego muzeum jest pokazanie rotmistrza Witolda Pileckiego nie tylko jako polskiego „superbohatera”, lecz także jako zwykłego człowieka – mówi Karol Madaj, dyrektor muzeum. – Chcemy opowiadać zarówno o szczegółach jego misji wywiadowczej w niemieckim obozie koncentracyjnym, jak i o wydarzeniach i ludziach kształtujących jego charakter. W soczewce historii miasta pokazujemy też losy Polski oraz dzieje Zagłady – bezprecedensowej zbrodni, o której informowały raporty Pileckiego z KL Auschwitz, a której jeden z pierwszych aktów rozegrał się nieopodal siedziby muzeum.